En la anastomosis en Y de Roux, una parte del estómago se separa del resto, creando una pequeña bolsa. La bolsa se conecta con la porción inferior del intestino delgado, en una disposición cuya forma se asemeja a la letra Y. El resultado es que se evita el paso por algunas partes del estómago y del intestino delgado. Sin embargo, los jugos procedentes del aparato digestivo (ácidos biliares y enzimas pancreáticas) siguen mezclándose con los alimentos, permitiendo al organismo absorber vitaminas y minerales, y reduciendo el riesgo de carencias nutricionales.