Muchas levaduras y mohos pueden causar infecciones oportunistas, que incluso ponen en peligro la vida de los pacientes inmunodeficientes. Estas infecciones rara vez afectan a individuos inmunocompetentes. Las levaduras tienden a provocar fungemia y compromiso localizado de la piel y otros sitios.
(Véase también Generalidades sobre las micosis Generalidades sobre las micosis Las infecciones micóticas (micosis) suelen clasificarse como Oportunista Primaria Las oportunistas son las que aparecen principalmente en huéspedes inmunocomprometidos. Pueden desarrollarse... obtenga más información ).
Blastoschizomyces capitatus y Trichosporon sp (incluyendo T. ovoides, T. inkin, T. asahii, T. mucoides, T. asteroides, y T. cutaneum) son levaduras que causan una infección diseminada, a menudo letal, en particular en pacientes neutropénicos. Entre las especies de Trichosporon, T. asahii es la causa más común de enfermedad diseminada. El nombre T. beigelii, ahora obsoleto, se utilizaba antes para todas o alguna de estas especies de Trichosporon.
Malassezia furfur es una levadura que causa tiña versicolor Tiña versicolor La tiña versicolor es la infección cutánea por el germen Malassezia furfur que se manifiesta con parches mútiples, asintomáticos, de colores variables, entre canela, marrón y rosado.... obtenga más información 
y foliculitis Foliculitis La foliculitis es una infección de los folículos pilosos. El diagnóstico es clínico. El tratamiento para la mayoría de los casos de foliculitis bacteriana se realiza con mupirocina o clindamicina... obtenga más información 
y también puede provocar sepsis relacionada con el catéter en pacientes que reciben lípidos parenterales a través de un catéter venoso central. La sepsis relacionada con el catéter afecta típicamente a lactantes y adultos frágiles que reciben infusiones de hiperalimentación IV que contienen lípidos. El personal del laboratorio de microbiología debe ser notificado cuando se intenta aislar Malassezia de muestras clínicas porque se requieren medios especiales.
Talaromyces marneffei (antes denominado Penicillium marneffei) es un invasor oportunista que causa infección generalizada en pacientes con sida que vivían en el sudeste asiático y también se informaron casos en viajeros que regresan a los Estados Unidos tras visitar esa región. Las lesiones cutáneas por T. marneffei pueden asemejarse a las del molusco contagioso.
Varios mohos ambientales, como especies de Fusarium y Scedosporium apiospermum (ambos cada vez más frecuentes), pueden ocasionar lesiones vasculíticas localizadas angioinvasoras que simulan aspergilosis Aspergilosis La aspergilosis es una infección oportunista que generalmente afecta las vías aéreas inferiores y es causada por la inhalación de esporas del hongo filamentoso Aspergillus, comúnmente... obtenga más información 
invasoras, en especial en pacientes neutropénicos. La especie de Fusarium causa infecciones superficiales (p. ej., queratitis, onicomicosis Onicomicosis La onicomicosis es la infección micótica de la lámina ungueal o el lecho ungueal. Las uñas presentan deformación y decoloración amarillenta o blanquecina. El diagnóstico se basa en el aspecto... obtenga más información 
) en pacientes inmunocompetentes e infecciones diseminadas en pacientes con inmunodepresión grave con neutropenia prolongada y grave y/o inmunodeficiencia grave de células T. La especie Fusarium (a diferencia de Aspergilli) puede crecer en hemocultivos de rutina de pacientes con infección diseminada. El voriconazol se considera el fármaco de elección tanto para Fusarium como para S. apiospermum.
El diagnóstico específico requiere cultivo e identificación de la especie, lo que resulta fundamental porque no todos estos microorganismos responden a un solo antimicótico. Por ejemplo, las especies de Scedosporium son característicamente resistentes a anfotericina B. Aún deben definirse regímenes terapéuticos óptimos para cada miembro de este grupo de hongos oportunistas.
