Los ovoquistes de Cyclospora no son esporulados (es decir, infecciosos) cuando se excretan en las heces. Por lo tanto, la transmisión directa fecal-oral no se produce.

1. Los ovoquistes no esporulados se excretan del huésped infectado a través de las heces.

2–3. Los ovoquistes esporulan en el ambiente después de 1 o 2 semanas a temperaturas entre 22 y 32° C.

4. Los ovoquistes esporulados contaminan los alimentos o el agua. No se comprobó el mecanismo de la contaminación.

5. Los ovoquistes esporulados se ingieren en alimentos o agua contaminados.

6. Los ovoquistes se exquistan en el tubo digestivo y liberan los esporozoitos, que invaden las células epiteliales del intestino delgado.

7. Dentro de las células, se multiplican por reproducción asexual y se desarrollan por reproducción sexual para madurar en ovoquistes, que se desprenden en las heces.