Table: Micro-organismes à l’origine d’une gastro-entérite

Micro-organismes à l’origine d’une gastro-entérite

Micro-organisme	Sources fréquentes	Symptômes	Usage antimicrobien
Astrovirus	Épidémiques et souvent saisonnières	Diarrhée aqueuse moins intense Vomissements et fièvre Les symptômes débutent 3 à 4 jours après l’infection Dure généralement entre 2 et 7 jours Similaire au rotavirus	Aucun antibiotique et médicament antiviral n’est administré.
Campylobacter	Consommation de viande contaminée (en particulier, de volaille insuffisamment cuite) Ingestion d’eau contaminée ou de lait non pasteurisé	Souvent, diarrhée sanglante, parfois aqueuse, qui peut durer de 1 jour à 1 semaine ou plus	Les antibiotiques administrés au stade précoce de la maladie peuvent réduire la durée des symptômes (par exemple, azithromycine ou ciprofloxacine).
Clostridium difficile	En général, surcroissance bactérienne chez des patients qui ont reçu des antibiotiques	Diarrhée	L’antibiotique responsable des symptômes est stoppé. Vancomycine ou fidaxomicine administrée par voie orale. Le métronidazole peut être administré aux personnes qui ne tolèrent pas la vancomycine et la fidaxomicine.
Cryptosporidium	En buvant de l’eau contaminée Transmission de personne à personne Exposition à des eaux récréatives Les personnes dont le système immunitaire est affaibli sont particulièrement sensibles	Diarrhée aqueuse, douleurs abdominales à type de crampes, nausées, fatigue et vomissements En général, dure environ 2 semaines	Des médicaments antiparasitaires sont parfois administrés (par exemple, nitazoxanide).
Entamoeba histolytica	Ingestion de nourriture ou d’eau contaminée	Diarrhée sanglante, douleur abdominale, perte de poids pendant 1 à 3 semaines Peut entraîner une infection du foie et d’autres organes	Des médicaments antiparasitaires sont administrés (par exemple, métronidazole, iodoquinol ou paromomycine).
Escherichia coli entéro-hémorragique (le plus souvent, E. coli O157:H7-{blank} Colite hémorragique)	Consommation de bœuf haché insuffisamment cuit ou de laits ou jus non pasteurisés En nageant dans des piscines contaminées Transmission de personne à personne En touchant des animaux infectés, puis en portant ses doigts à la bouche	Crampes abdominales soudaines, diarrhée aqueuse qui devient généralement sanglante dans un délai de 1 à 3 jours, et syndrome hémolytique et urémique chez environ 5 % des personnes	Les antibiotiques augmentent le risque de développer un syndrome hémolytique et urémique et ne sont donc pas prescrits.
Escherichia coli entéro-toxinogène (responsable de la turista)	Ingestion de nourriture ou d’eau contaminée	Diarrhée aqueuse fréquente Dure généralement entre 3 et 5 jours	Les antibiotiques (par exemple, ciprofloxacine ou lévofloxacine) pourraient limiter la durée de la maladie. De l’azithromycine est administrée aux enfants.
Giardia	En buvant de l’eau contaminée Transmission de personne à personne, notamment dans les garderies	Diarrhée, nausées et perte d’appétit Des troubles de plus longue durée (plusieurs jours ou semaines) sont possibles, avec selles d’aspect huileux, ballonnements abdominaux, flatulences et perte de poids	Des médicaments antiparasitaires sont administrés (par exemple, métronidazole ou nitazoxanide).
Adénovirus intestinal	Épidémiques et souvent saisonnières	Diarrhée aqueuse fréquente qui dure 1 à 2 semaines Légers vomissements qui débutent 1 à 2 jours après la diarrhée La fièvre touche 50 % des personnes Les symptômes débutent 3 à 10 jours après l’infection En général, dure au moins 10 jours	Aucun antibiotique et médicament antiviral n’est administré.
Norovirus	Épidémiques et souvent saisonnières	Diarrhée aqueuse fréquente Vomissements, en particulier chez les enfants Crampes d’estomac, maux de tête, courbatures et douleurs On observe une fièvre supérieure à environ 39 °C chez environ 30 % des personnes Les diarrhées affectent généralement l’adulte Les symptômes débutent 1 à 2 jours après l’infection Dure généralement entre 2 et 7 jours	Aucun antibiotique et médicament antiviral n’est administré.
Rotavirus	Épidémiques et souvent saisonnières	Diarrhée aqueuse fréquente Vomissements et fièvre supérieure à 39 °C environ Les symptômes débutent 1 à 3 jours après l’infection Peuvent durer 5 à 7 jours	Aucun antibiotique et médicament antiviral n’est administré. Des vaccins sont disponibles pour le nourrisson.
Salmonella	Consommation d’aliments contaminés Contact avec des reptiles (par exemple, iguanes, serpents et tortues), des oiseaux ou des amphibiens (par exemple, grenouilles et salamandres)	Fièvre élevée, épuisement, crampes abdominales, nausées, vomissements, diarrhée qui peut ou non être sanglante Les symptômes durent généralement 3 à 7 jours	En général, aucun traitement antibiotique n’est administré.
Shigella	Transmission de personne à personne, notamment dans les garderies	Peut être d’intensité légère ou grave Dans les cas légers, selles molles, aqueuses Dans les cas graves, fièvre élevée, épuisement, fortes crampes abdominales, évacuation douloureuse de selles contenant du sang et du mucus En général, les symptômes durent environ une semaine en l’absence de traitement	Les antibiotiques réduisent la durée de la maladie et le risque de diffusion à d’autres personnes (par exemple, ciprofloxacine ou triméthoprime-sulfaméthoxazole).
Staphylococcus aureus (voir aussi Intoxication alimentaire à staphylocoque) Bacillus cereus Clostridium perfringens	Aliments contaminés par les toxines produites par la bactérie	Nausées, vomissements et diarrhées sévères Les symptômes commencent dans les 12 heures suivant l’ingestion de l’aliment contaminé et disparaissent progressivement dans un délai de 36 heures	Aucun traitement antibiotique n’est administré.
Vibrio cholerae	Ingestion de nourriture ou d’eau contaminée	Diarrhée aqueuse indolore et vomissements Peut entraîner des pertes de liquides considérables et un choc	Des antibiotiques sont administrés (par exemple, ciprofloxacine ou doxycycline).
Autres types de Vibrio	Fruits de mer	Diarrhée aqueuse, souvent accompagnée de quelques nausées ou vomissements	Des antibiotiques sont administrés (par exemple, ciprofloxacine, doxycycline ou triméthoprime/sulfaméthoxazole).

Le Manuel Merck

Micro-organismes à l’origine d’une gastro-entérite