Les oocystes de Cystoisospora belli ne sont pas sporulés (c.-à-d. infectieux) lorsqu’ils sont éliminés dans les selles. Par conséquent, une transmission oro-fécale directe ne survient pas.

1. Les oocystes immatures sont excrétés dans les selles. Chaque oocyste contient en général un sporoblaste. Le sporoblaste se divise en deux et sécrète une paroi kystique, donnant deux sporocystes. Les sporocystes se divisent et produisent des sporozoïtes.

2. Les oocystes sont ingérés et excrétés hors du kyste. Les sporozoïtes sont libérés et envahissent les cellules épithéliales.

3–5. À l’intérieur des cellules, ils se multiplient de façon asexuée. Après au moins une semaine, des gamétocytes masculins et féminins se développent. La fécondation produit des oocystes, qui sont excrétés dans les selles.