Maladies infectieuses - Édition professionnelle du Manuel MSD

Biologie des maladies infectieuses

Un individu sain vit en harmonie avec la flore microbienne qui le protège de l'invasion par des germes pathogènes, habituellement définis comme des microrganismes qui ont la capacité de déclencher une maladie. La flore microbienne, principalement bactérienne et fongique, comprend la flore résidante normale qui est systématiquement présente et se reforme rapidement en cas de destruction, et la flore transitoire qui peut coloniser un hôte pendant des heures voire des semaines, mais qui ne s'installe pas définitivement. Les microrganismes de la flore normale peuvent parfois déclencher une maladie, en particulier en cas d'altération des défenses de l'hôte.
Diagnostic biologique des maladies infectieuses

Les examens biologiques permettent d'identifier les microrganismes de façon directe (p. ex., examen macroscopique, microscopique, mises en culture) ou indirectement (p. ex., par recherche d'anticorps spécifiques d'un microrganisme). Les principaux types de tests comprennent les suivants
Vaccination

L'immunité peut être obtenue
Bactéries anaérobies

Les bactéries peuvent être classées selon leur besoin et leur tolérance à l'oxygène:
Prise en charge des infections parasitaires

Les parasites de l'homme sont des microrganismes qui vivent sur ou dans une personne et tirent leurs nutriments de cette personne (l'hôte). Il existe 3 types de parasites:
- Prise en charge des infections parasitaires
Arbovirus, Arenaviridae, et Filoviridae

Le terme d'arbovirus (arthropod-borne virus) s'applique à tout virus transmis aux humains et/ou à d'autres vertébrés par certains types d'arthropodes hématophages, principalement les insectes (mouches et moustiques) et arachnides (tiques). L'arbovirus ne fait pas partie du système actuel de classification des virus, qui est basé sur la nature et la structure du génome viral.
Bactéries et médicaments antibactériens

Les bactéries sont des microrganismes qui ont un ADN double brin circulaire et (à l'exception des mycoplasmes) des parois cellulaires. La plupart des bactéries sont extracellulaires, mais certaines résident et se répliquent préférentiellement en intracellulaire. Les agents pathogènes intracellulaires obligatoires sont capables de se développer, de se reproduire et de provoquer une maladie uniquement dans les cellules de l'hôte. Des exemples de ces agents pathogènes comprennent les Chlamydiae, Chlamydophila spp et les rickettsies. Les pathogènes intracellulaires facultatifs peuvent vivre et se reproduire à l'intérieur ou à l'extérieur des cellules hôtes. Des exemples de ces agents pathogènes comprennent Salmonella typhi, Brucella spp, Francisella tularensis, Neisseria gonorrhoeae, N. meningitidis, Legionella et Listeria spp, et Mycobacterium tuberculosis.
Cestodes (Ténias)

Les ténias (cestodes) sont des vers plats parasites. Les quatre principaux cestodes pathogènes intestinaux de l'homme sont
Chlamydia et mycoplasmes

Trois espèces de Chlamydia sont pathogènes pour l'homme, notamment responsables d'infections sexuellement transmissibles et d'infections respiratoires. Toutes sont sensibles aux macrolides (p. ex., l'azithromycine), aux tétracyclines (p. ex., la doxycycline) et aux fluoroquinolones.
- ChlamydiaChlamydia
- Mycoplasmes
  - Traitement
COVID-19

Le COVID-19 est une maladie respiratoire aiguë, parfois grave, provoquée par le nouveau coronavirus, le SRAS-CoV-2.
- COVID-19
Entérovirus

L'entérovirus, ainsi que les rhinovirus (voir Rhume banal) et les paréchovirus humains, sont des genre des picornavirus (pico, ou petits virus à ARN). Tous les entérovirus sont antigéniquement hétérogènes et ont une large répartition géographique.
Protozoaires extra-intestinaux

Les amibes libres sont des protozoaires qui vivent de façon indépendante dans le sol ou l'eau et ne nécessitent ni hôte humain ni animal. Elles ne provoquent que rarement une maladie, contrairement à l'amibe parasite de l'intestin Entamoeba histolytica, qui est un agent fréquent d'infection intestinale ( amibiase). Les amibes libres pathogènes appartiennent aux genres Acanthamoeba, Balamuthia, Naegleria et Sappinia.
Mycoses

Les infections mycosiques sont souvent classées comme
Bacilles Gram négatifs

Les bacilles Gram négatifs sont responsables de nombreuses pathologies. Certains sont des microrganismes commensaux présents dans la flore intestinale normale. Ces microrganismes commensaux ainsi que d'autres provenant de réservoirs animaux ou environnementaux peuvent devenir pathogènes.
Cocci et coccobacilles à Gram négatif

Acinetobacter spp sont des microrganismes Gram-négatifs pouvant causer des infections suppuratives dans tous les organes; ces bactéries sont souvent opportunistes chez les patients hospitalisés.
Cocci Gram positifs

Les entérocoques sont des microrganismes anaérobies facultatifs à Gram positif. Enterococcus faecalis et E. faecium provoquent toute une gamme d'infections, dont des endocardites, des infections urinaires, des prostatites, des infections intra-abdominales, une cellulite et des infections de plaies, ainsi que des bactériémies concomitantes.
Bacilles Gram positifs

Le charbon (anthrax) est dû à Bacillus anthracis, un bacille gram-positif, qui est un microrganisme anaérobie facultatif encapsulé producteur de toxines. Le charbon (anthrax), une maladie souvent mortelle chez les animaux, est transmis à l'homme par contact avec des animaux infectés ou leurs produits. Chez l'homme, l'infection est habituellement contractée via la peau. Les infections pulmonaires sont moins fréquentes; les infections méningées et gastro-intestinales sont rares. Dans les infections par inhalation et les infections gastro-intestinales, des symptômes locaux non spécifiques sont habituellement suivis en quelques jours d'atteintes généralisées sévères, d'un état de choc et souvent de la mort. Le traitement empirique repose sur la ciprofloxacine, la lévofloxacine, la moxifloxacine ou la doxycycline. Un vaccin est disponible.
Virus herpétiques (herpes virus)

Huit Virus herpétiques (herpes virus) différents infectent l'homme (). Après l'infection initiale, tous les Virus herpétiques (herpes virus) restent latents dans les cellules hôtes spécifiques et peuvent ultérieurement se réactiver. Les syndromes cliniques dus à la primo-infection peuvent être très différents de ceux provoqués par la réactivation de ces virus. Les Virus herpétiques (herpes virus) ne survivent pas longtemps en dehors de l'hôte; ainsi, la transmission nécessite habituellement un contact intime. Chez le sujet présentant une infection latente, le virus peut se réactiver sans causer de symptômes; dans de tels cas, une excrétion asymptomatique se produit et le sujet peut transmettre l'infection.
Virus de l'immunodéficience humaine (VIH)

L'infection par le virus de l'immunodéficience humaine (VIH) est due à 1 de 2 rétrovirus similaires (VIH-1 et VIH-2) qui détruisent les lymphocytes CD4+ et perturbent le fonctionnement de l'immunité à médiation cellulaire, ce qui entraîne une augmentation du risque de certaines infections et de certains cancers. L'infection initiale peut entraîner une maladie fébrile non spécifique. Le risque de manifestations ultérieures, liées au déficit immunitaire, est proportionnel au taux de déplétion lymphocytaire CD4+. Le VIH peut léser directement le cerveau, les gonades, les reins et le cœur, provoquant un déficit cognitif, un hypogonadisme, une insuffisance rénale et une cardiomyopathie. Les manifestations peuvent aller de formes asymptomatiques, au syndrome d'immunodéficience acquise (SIDA), qui se définit par des infections opportunistes sévères ou des cancers ou une numération des CD4 200/mcL. L'infection par le VIH peut être diagnostiquée au moyen de test des anticorps, des acides nucléiques (ARN du VIH) ou des Ag (p24). Ces tests de dépistage doivent être systématiquement proposés aux adultes et aux adolescents. Le traitement vise à supprimer la réplication du VIH en utilisant des associations de ≥ 2 médicaments qui inhibent les enzymes du VIH; le traitement peut restaurer la fonction immunitaire chez la plupart des patients si la suppression de la réplication est soutenue.
Protozoaires intestinaux et microsporidies

Les pathogènes protozoaires intestinaux les plus importants sont
Mycobactérie

La tuberculose (TB) est une infection mycobactérienne chronique, évolutive, souvent avec une période de latence qui fait suite à l'infection initiale. La tuberculose affecte le plus souvent les poumons. Les symptômes comprennent une toux productive, de la fièvre, une perte de poids et une sensation de malaise. Le diagnostic est le plus souvent établi par le frottis et la culture et, de plus en plus, par des tests diagnostiques moléculaires rapides. Le traitement repose sur une association de médicaments antimicrobiens administrés pendant 6 mois au moins.
Nématodes (vers ronds)

L'angiostrongylose est une infection transmise par les larves de vers du genre Angiostrongylus. Selon les espèces infectantes, il en résulte des symptômes abdominaux (Angiostrongylus costaricensis) ou une atteinte neurale avec une méningite à éosinophiles (A. cantonensis). Le diagnostic est suspecté sur l'anamnèse et la présence d'éosinophilie dans le liquide céphalorachidien et/ou dans le sang. Les anthelminthiques sont soit inefficaces, soit délétères.
Virus de la variole

La variole du singe est provoquée par le virus de la variole du singe, un orthopoxvirus structurellement apparentée au virus de la variole. Les patients présentent initialement une éruption vésiculaire ou pustuleuse qui peut être douloureuse et souvent de la fièvre, une sensation de malaise et une lymphadénopathie. Le diagnostic repose sur la PCR. Le traitement est généralement symptomatique et potentiellement par des médicaments antiviraux. La prévention comprend la vaccination.
- Monkey Pox (variole du singe)
- Variole
Virus respiratoires

Les infections virales affectent fréquemment le tractus respiratoire supérieur ou inférieur. Bien que les infections respiratoire puissent être classées selon le virus responsable (p. ex., influenza), elles sont généralement classées selon les syndromes cliniques (p. ex., rhume banal, bronchiolite, laryngite striduleuse, pneumonie). Bien que les agents pathogènes spécifiques entraînent des manifestations cliniques caractéristiques (p. ex., les rhinovirus causent habituellement un rhume banal ou le virus respiratoire syncytial [VRS] qui provoque habituellement une bronchiolite), chacun peut causer de nombreux syndromes viraux des voies respiratoires.
Rickettsia et microrganismes apparentés

Les rickettsioses et les maladies liées (anaplasmose, ehrlichiose, fièvre Q, typhus des broussailles) sont dues à un groupe de coccobacilles nécessairement intracellulaires, Gram négatifs. Tous sauf Coxiella burnetii, ont un arthropode vecteur. La symptomatologie comprend habituellement une fièvre d'apparition brutale accompagnée de céphalées intenses, d'une sensation de malaise, de prostration et, dans la plupart des cas, d'une éruption caractéristique. Le diagnostic est clinique et confirmé par immunofluorescence ou Polymerase Chain Reaction (PCR). Le traitement repose sur les tétracyclines ou, sauf en cas d'anaplasmose et d'ehrlichiose, sur le chloramphénicol.