Infection à Clostridioides difficile

(Colite à C. diff ; Colite pseudomembraneuse ; C. diff)

ParLarry M. Bush, MD, FACP, Charles E. Schmidt College of Medicine, Florida Atlantic University;
Maria T. Vazquez-Pertejo, MD, FACP, Wellington Regional Medical Center
Révisé parBrenda L. Tesini, MD, University of Rochester School of Medicine and Dentistry
Revue/Révision complète Modifié déc. 2025
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Les faits en bref

L’infection à Clostridioides difficile résulte généralement d’une inflammation du gros intestin (côlon) provoquée par une toxine produite par la bactérie C. difficile. L’affection se développe généralement après la prise d’antibiotiques qui permettent à ces bactéries de se développer dans l’intestin.

  • L’infection à Clostridioides difficile survient généralement après la prise d’antibiotiques.

  • Les symptômes typiques varient de selles légèrement molles à des diarrhées sanglantes, des douleurs abdominales et de la fièvre.

  • Les médecins analysent les selles et utilisent parfois une sonde dotée d’une caméra pour examiner le gros intestin.

  • La plupart des personnes atteintes d’une infection légère à C. difficile se rétablissent après l’arrêt de l’antibiotique qui a déclenché la diarrhée et la prise d’un autre antibiotique.

Les bactéries Clostridioides difficile (C. difficile, C. diff) sont anaérobies et n’ont pas besoin d’oxygène pour vivre.

Le saviez-vous ?

  • La bactérie C. difficile vit dans les intestins de certaines personnes en bonne santé.

(Voir aussi Présentation des infections à clostridium.)

Causes de l’infection à Clostridioides difficile

Dans le cadre de l’infection à C. difficile (ICD), la bactérie produit des toxines qui peuvent provoquer une inflammation du côlon (colite) et une diarrhée. Elle se développe généralement après la prise d’antibiotiques pour traiter une infection. De nombreux antibiotiques modifient l’équilibre entre les types et le nombre de bactéries qui vivent dans l’intestin. Ainsi, certaines bactéries pathogènes, telles que C. difficile, peuvent proliférer et remplacer les bactéries inoffensives qui vivent normalement dans l’intestin. C. difficile est la cause la plus fréquente de diarrhée qui se développe après la prise d’antibiotiques. L’infection à C. difficile survient généralement lorsque des antibiotiques sont administrés par voie orale, mais elle peut aussi survenir lorsque les antibiotiques sont injectés dans un muscle ou administrés par voie intraveineuse.

Lorsque la bactérie C. difficile prolifère, elle libère des toxines qui entraînent des diarrhées, une colite et, parfois, la formation de membranes anormales (pseudomembranes) dans le gros intestin.

Une souche plus mortelle de C. difficile est la cause de certaines épidémies nosocomiales. Cette souche produit significativement plus de toxines, provoque une maladie plus grave avec une plus grande probabilité de rechute, est facilement transmissible et répond moins bien au traitement antibiotique.

Presque tous les antibiotiques peuvent provoquer une ICD, mais la clindamycine, les pénicillines (en particulier l’ampicilline et l’amoxicilline), les céphalosporines (comme la ceftriaxone) et les fluoroquinolones (comme la lévofloxacine et la ciprofloxacine) présentent le risque le plus élevé de provoquer une colite. L’ICD peut survenir même après la prise d’antibiotiques pendant une période très courte. Certains médicaments de chimiothérapie anticancéreuse peuvent également entraîner une ICD.

Autres facteurs de risque d’ICD :

  • Âge avancé

  • Présenter un ou plusieurs autres troubles sévères

  • Séjour prolongé à l’hôpital

  • Vie en maison de santé

  • Chirurgie abdominale

  • Affection ou prise d’un médicament réduisant l’acidité gastrique

La chirurgie de l’estomac, de l’intestin grêle ou du gros intestin peut perturber l’équilibre des bactéries dans le tube digestif et augmenter le risque de développer une ICD.

Les médicaments qui diminuent l’acidité gastrique incluent les inhibiteurs de la pompe à protons et les antihistaminiques H2 (H2), qui sont utilisés pour traiter le reflux gastro-œsophagien et l’ulcère gastroduodénal.

Parfois, la bactérie provient du propre tractus intestinal du patient. Par exemple, C. difficile est fréquemment présent dans les intestins de certains adultes en bonne santé, adultes hospitalisés et personnes vivant dans des établissements de soins de longue durée (comme une maison de retraite). Chez ces personnes, les bactéries C. difficile ne provoquent généralement pas de symptômes ni de maladie, sauf en cas de prolifération excessive. Cependant, ces personnes peuvent transmettre des clostridies aux personnes à risque. La transmission d’une personne à une autre peut être empêchée en se lavant méticuleusement les mains.

Les personnes peuvent également contracter les bactéries provenant d’animaux de compagnie ou de l’environnement.

Symptômes de l’infection à Clostridioides difficile

Les symptômes débutent généralement 5 à 10 jours après l’instauration du traitement antibiotique, mais peuvent survenir le premier jour ou jusqu’à 2 mois plus tard.

Les symptômes varient selon le degré d’inflammation provoqué par les bactéries, allant de l’émission de selles relativement molles à une diarrhée sanglante, avec douleurs et crampes abdominales et fièvre. Les nausées et vomissements sont rares.

Les personnes qui développent une infection sévère appelée colite fulminante ont plus de douleurs et sont très malades. Elles peuvent développer une déshydratation potentiellement mortelle, une accélération du rythme cardiaque, une hypotension artérielle et une perforation du gros intestin.

Diagnostic de l’infection à Clostridioides difficile

  • Analyses des selles

  • Parfois, sigmoïdoscopie

Les médecins soupçonnent une ICD chez toute personne développant une diarrhée nouvelle et persistante dans les 2 mois suivant la prise d’un antibiotique ou dans les 72 heures suivant une hospitalisation.

Les médecins confirment le diagnostic avec plusieurs analyses de selles. Les médecins recherchent les toxines produites par C. difficile ainsi qu’une enzyme libérée par la bactérie. Les médecins réalisent également des tests utilisant la technique de PCR (amplification en chaîne par polymérase) afin de détecter la présence du matériel génétique (ADN) de la bactérie dans les selles.

Les médecins peuvent également diagnostiquer une ICD en inspectant le segment inférieur du gros intestin enflammé (côlon sigmoïde), généralement au moyen d’un sigmoïdoscope (sonde d’observation souple) ou l’intégralité du côlon au moyen d’un colonoscope. S’ils observent un type d’inflammation spécifique appelé colite pseudomembraneuse, l’ICD est le diagnostic probable.

Les médecins peuvent réaliser des examens d’imagerie, comme des radiographies abdominales ou une tomodensitométrie (TDM), s’ils soupçonnent une complication grave, comme une perforation du gros intestin ou une colite fulminante.

Traitement de l’infection à Clostridioides difficile

  • Arrêt de l’antibiotique à l’origine de la diarrhée

  • Antibiotiques efficaces contre C. difficile

  • Pour les récidives, antibiotiques

  • Pour les récidives fréquentes, parfois transplantation fécale (selles)

Les personnes qui développent une diarrhée alors qu’elles prennent un antibiotique susceptible de provoquer une diarrhée induite par C. difficile doivent arrêter de prendre l’antibiotique dès que possible.

La plupart des personnes atteintes d’une infection à C. difficile (ICD) sont traitées avec l’antibiotique vancomycine ou fidaxomicine par voie orale pendant 10 jours. La fidaxomicine est plus efficace que la vancomycine pour réduire le risque de récidive des symptômes.

Les médicaments que les personnes prennent parfois pour ralentir le transit intestinal et traiter la diarrhée (comme le lopéramide) ne doivent pas être pris. Ces médicaments peuvent prolonger ou aggraver la diarrhée en maintenant la toxine pathogène au contact du gros intestin.

Parfois, l’ICD est si sévère que la personne doit être hospitalisée pour recevoir des liquides par voie intraveineuse, des électrolytes (comme le sodium, le magnésium, le calcium et le potassium) et, dans de rares cas, des transfusions sanguines si la diarrhée sanglante a provoqué une perte de sang importante.

Dans de rares cas, une intervention chirurgicale est nécessaire. Par exemple, l’ablation chirurgicale du gros intestin (colectomie) peut être nécessaire dans des cas graves, comme une mesure salvatrice.

Traitement des récidives

La diarrhée réapparaît chez 15 à 20 % des personnes présentant cette affection, généralement dans les semaines qui suivent l’arrêt du traitement. Dès que la diarrhée réapparaît, les personnes prennent un autre cycle de fidaxomicine. Si la diarrhée continue à réapparaître, les personnes reçoivent également de la vancomycine puis de la rifaximine.

La transplantation fécale (selles) constitue une option pour certaines personnes qui présentent des récurrences fréquentes. Dans cette procédure, environ une tasse (environ 200 à 300 millilitres) de matière fécale provenant d’un donneur sain est placée dans le côlon de la personne infectée. La matière fécale du donneur est tout d’abord analysée à la recherche de micro-organismes pouvant provoquer une maladie. La transplantation fécale peut être administrée sous forme de lavement, par le biais d’une sonde insérée par le nez dans le tube digestif, ou par un coloscope (microbiote fécal, live-jslm), ou prise sous forme de comprimé contenant des selles de donneurs sains (spores de microbiote fécal, live-brpk). Les matières fécales d’un donneur restaurent l’équilibre bactérien normal du côlon de la personne présentant une infection à C. difficile. Après ce traitement, il est moins probable que les symptômes réapparaissent.

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