Revue générale des infections intestinales à protozoaires et microsporidies

Le mot « protozoaire » est un terme vague pour désigner certains microrganismes unicellulaires nucléés (eucaryotes) qui n'ont pas de paroi cellulaire et qui ne sont ni des animaux, ni des plantes, ni des champignons. Les protozoaires intestinaux pathogènes les plus importants qui causent des infections entériques chez l'homme comprennent

• Cryptosporidium species (voir Cryptosporidiose)

• Cyclospora cayetanensis (voir Cyclosporose)

• Cystoisospora belli (précédemment connu sous le nom de Isospora belli—voir Cystoisosporose)

• Entamoeba histolytica (voir Amibiase)

• Giardia duodenalis (précédemment connue sous les noms de G lamblia, G intestinalis—voir Giardiase) 

Les membres du phylum Microsporidia étaient classés parmi les protozoaires mais sont maintenant, d'après des études ADN, considérés comme des champignons ou en sont très proches.

Des parasites pathogènes et des microrganismes non pathogènes commensaux multiples peuvent être présents dans l'intestin en même temps.

Les protozoaires intestinaux se propagent par voie orofécale, et sont à l'origine d'infections largement répandues dans les régions aux structures sanitaires inadéquates et où le traitement de l'eau n'est pas adapté. Ils sont fréquents dans les lieux où se produisent des incontinences fécales ou lorsque l'hygiène est défectueuse, comme cela peut se produire dans les établissements psychiatriques et dans les crèches. Certains protozoaires digestifs se transmettent par voie sexuelle, en particulier lors de pratiques impliquant un contact oro-anal. Plusieurs espèces de protozoaires provoquent des infections opportunistes sévères chez les patients immunodéprimés, y compris ceux atteints par le virus de l'immunodéficience humaine (VIH).

Aux États-Unis, il est parfois arrivé que de vastes épidémies d'infections intestinales à protozoaires d'origine alimentaire ou hydrique se produisent (p. ex., l'épidémie d'infection par Cyclospora cayetanensis touchant plusieurs États attribuée à des plateaux de légumes frais contaminés en 2018 et l'épidémie massive d'origine hydrique de Cryptosporidium à Milwaukee en 1993).

Les maladies systémiques à protozoaires sont discutées ailleurs et comprennent le paludisme, la babésiose, la toxoplasmose, la leishmaniose, la maladie de Chagas et la trypanosomiase africaine.