Revue générale des anomalies chromosomiques

• Analyse chromosomique (caryotype)

• Banding

• Fluorescent in situ hybridization (hybridation in situ en fluorescence) (FISH)

• Analyse chromosomique par microarray (array comparative genomic hybridization)

(Voir aussi les technologies de séquençage de nouvelle génération.)

Les anomalies chromosomiques plus importantes sont visibles au niveau microscopique (p. ex., sur un caryotype) comparativement aux microdélétions, microduplications et défauts monogéniques (comme les insertions, délétions, inversions ou substitutions de paires de bases), qui nécessitent des tests plus spécialisés. La mitose est au cœur de l'analyse dans de nombreuses études chromosomiques car elle produit des cellules somatiques dotées d'un chromosome diploïde visible, où les anomalies sont facilement visualisées. Les phases de la mitose par ordre chronologique sont la prophase, la prométaphase, la métaphase (où les chromosomes sont les plus condensés), l'anaphase et la télophase.

L'analyse chromosomique porte généralement sur des lymphocytes, sauf au cours de la période prénatale, où des amniocytes ou des cellules placentaires de villosités choriales sont utilisées (voir Amniocentèse et Prélèvement de villosités choriales). L'analyse du caryotype consiste à bloquer les cellules en mitose au cours de la métaphase et à colorer les chromosomes condensés. Les chromosomes des cellules sont photographiés au moyen de systèmes d'acquisition d'images numériques, et leurs images sont assemblées pour former un caryotype.

Plusieurs techniques sont utilisées pour mieux visualiser les chromosomes:

• Dans le banding classique (p. ex., banding G [Giemsa], Q [fluorescent] et C), un colorant est utilisé pour colorer les bandes situées sur les chromosomes.

• L'analyse chromosomique à haute résolution utilise des méthodes de culture spéciales pour obtenir un pourcentage élevé de prophases et de prométaphases. En raison de la prédominance de la prophase et de la prométaphase, les chromosomes sont moins condensés que lors d'une analyse de métaphase standard et le nombre de bandes identifiables est augmenté, ce qui permet une analyse plus fine du caryotype.

• L'analyse spectrale du caryotype (également appelée caryotypage spectral) utilise des techniques de FISH (hybridation in situ fluorescente) multicolores et spécifiques des chromosomes, ce qui améliore la visibilité de certaines anomalies, notamment les translocations et les inversions.

• L'analyse chromosomique par microarray (Chromosomal microarray analysis [CMA]), également appelée hybridation génomique comparative sur puce (aCGH), est une technique en une seule étape qui permet de scanner l'ensemble du génome à la recherche d'anomalies de dosage des chromosomes, dont des augmentations (duplications) ou des diminutions (délétions), ce qui peut également suggérer une translocation déséquilibrée. L'analyse par microréseau d'oligonucléotides (SNP microarray analysis) est un type d'analyse par microarrays (analyse chromosomique par microréseau) qui permet également de détecter les régions d'homozygotie, lesquelles peuvent être observées dans les cas où les parents ont une ascendance commune (consanguinité), ainsi qu'en cas de disomie uniparentale (c'est-à-dire, que les deux copies d'un chromosome, ou d'une partie de chromosome, sont héritées d'un seul parent, au lieu d'une copie de la mère et une copie du père). Il est important de noter que l'analyse chromosomique par microarray, également appelée array comparative genomic hybridization) ne détecte pas les réarrangements équilibrés (p. ex., translocations, inversions) qui ne sont pas associés à des suppressions ou à des duplications.