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Le Manuel Merck

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Introduction au diagnostic biologique des maladies infectieuses

Par

Maria T. Vazquez-Pertejo

, MD, FACP, Wellington Regional Medical Center

Dernière révision totale juin 2020| Dernière modification du contenu juin 2020
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Les examens biologiques permettent d'identifier les microrganismes de façon directe (p. ex., examen macroscopique, microscopique, mises en culture) ou indirectement (p. ex., par recherche d'Ac spécifiques d'un microrganisme). Les principaux types de tests comprennent les suivants

La culture est généralement l'examen de référence pour l'identification des microrganismes, mais les résultats peuvent nécessiter plusieurs jours ou semaines pour revenir et les microrganismes pathogènes ne poussent pas toujours en culture, d'où l'intérêt des autres examens. Lorsqu'un germe pathogène est cultivé et identifié, le laboratoire peut également tester sa sensibilitéaux agents antimicrobiens. Parfois, des méthodes moléculaires peuvent être utilisées pour détecter des gènes de résistance spécifiques.

Certains tests (p. ex., coloration de Gram, culture aérobie standard) permettent de détecter une grande variété de microrganismes pathogènes et sont réalisés de façon systématique en cas de suspicion de pathologie infectieuse. Cependant, certains agents pathogènes n'étant pas identifiés par ces tests, les médecins doivent être conscients des limites de ces tests pour chaque bactérie suspectée. Dans de tels cas, il faut demander des tests spécifiques de l'agent pathogène suspecté (p. ex., colorations ou milieux de culture spéciaux) ou informer le laboratoire du ou des microrganismes suspectés afin qu'ils puissent choisir des tests plus spécifiques. (Voir le tableau Tests diagnostiques pour des agents pathogènes courants.)

Tableau
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Tests diagnostiques pour des agents pathogènes courants

Microorganisme

Microscopie

Culture

Test d'amplification des acides nucléiques

Détection de l'antigène

Détection d'anticorps

Bactéries

Erysipelothrix spp

Rhodococcus equus

X

Mycobactérie

Tuberculose et ulcères

Organismes intracellulaires

Mycoses

Virus

Virus BK

Hépatite A, B, C, D et E

VIH

virus JC

Virus LaCrosse

Virus de l'encéphalite de St. Louis

Virus de l'encéphalite à tiques

Virus West Nile (virus du Nil occidental)

Protozoaires et parasites

Nématodes intestinaux

Adapté d'après Bennett JE, Dolin R, Blaser MJ: Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases, 9th Edition. Elsevier, 2020.

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