Les examens biologiques permettent d'identifier les microrganismes de façon directe (p. ex., examen macroscopique, microscopique, mises en culture) ou indirectement (p. ex., par recherche d'anticorps spécifiques d'un microrganisme). Les principaux types de tests comprennent les suivants
Tests immunologiques Tests immunologiques des maladies infectieuses Les examens immunologiques utilisent l'un des éléments suivants: Un antigène pour détecter des anticorps dirigés contre un agent pathogène dans un prélèvement du patient Anticorps pour détecter... en apprendre davantage (tests d'agglutination comme l'agglutination au latex, les dosages immunoenzymatiques, Western Blot, techniques de précipitation et réactions de fixation du complément)
Méthodes d'identification basées sur les acides nucléiques Méthodes basées sur les acides nucléiques d'identification des maladies infectieuses Les méthodes génotypiques détectent les séquences d'ADN ou d'ARN extraites du microrganisme et spécifiques de ce microrganisme. Les séquences peuvent ou non être amplifiées in vitro. L'identification... en apprendre davantage
Méthodes d'identification non basées sur les acides nucléiques Méthodes d'identification non basées sur les acides nucléiques des maladies infectieuses Lorsqu'un microrganisme a été isolé par culture, il doit être identifié. L'identification est importante pour déterminer la prise en charge (p. ex., traitement médicamenteux, mesures d'isolement)... en apprendre davantage
La culture est généralement l'examen de référence pour l'identification des microrganismes, mais les résultats peuvent nécessiter plusieurs jours ou semaines pour revenir et les microrganismes pathogènes ne poussent pas toujours en culture, d'où l'intérêt des autres examens. Lorsqu'un germe pathogène est cultivé et identifié, le laboratoire peut également tester sa sensibilité Antibiogramme Les antibiogrammes permettent de déterminer la sensibilité d'un microrganisme en mettant en présence une concentration standard du germe et des concentrations spécifiques d'antibiotiques. Les... en apprendre davantage aux agents antimicrobiens. Parfois, des méthodes moléculaires peuvent être utilisées pour détecter des gènes de résistance spécifiques.
Certains tests (p. ex., coloration de Gram, culture aérobie standard) permettent de détecter une grande variété de microrganismes pathogènes et sont réalisés de façon systématique en cas de suspicion de pathologie infectieuse. Cependant, certains agents pathogènes n'étant pas identifiés par ces tests, les médecins doivent être conscients des limites de ces tests pour chaque bactérie suspectée. Dans de tels cas, il faut demander des tests spécifiques de l'agent pathogène suspecté (p. ex., colorations ou milieux de culture spéciaux) ou informer le laboratoire du ou des microrganismes suspectés afin qu'ils puissent choisir des tests plus spécifiques.
Tests diagnostiques pour certains pathogènes bactériens
Microorganisme | Microscopie | Culture | test d'amplification des acides nucléiques | Détection de l'antigène | Détection d'anticorps |
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Clostridioides difficile Diarrhée induite par Clostridioides (anciennement, Clostridium) difficile Les toxines produites par des souches de Clostridioides difficile dans le tube digestif entraînent une colite pseudo-membraneuse, habituellement après l'utilisation d'antibiotiques. Les... en apprendre davantage | ✓ | ✓ | ✓ | ||
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Rhodococcus equus | ✓ | ✓ | |||
Espèces rickettsiennes | ✓ | ✓ | |||
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Adapted from Bennett JE, Dolin R, Blaser MJ: Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases, 9th Edition. Elsevier, 2020. | |||||
* Test non largement disponible en pratique clinique. | |||||
NAAT = Nucleic Acid Amplification Test (Test d'amplification des acides nucléiques) |
Tests diagnostiques pour des agents pathogènes mycobactériens
Microorganisme | Microscopie | Culture | test d'amplification des acides nucléiques | Détection de l'antigène | Détection d'anticorps |
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Mycobacterium leprae | ✓ | ✓ | ✓ | ||
Adapted from Bennett JE, Dolin R, Blaser MJ: Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases, 9th Edition. Elsevier, 2020. | |||||
* Test non largement disponible en pratique clinique. | |||||
NAAT = Nucleic Acid Amplification Test (Test d'amplification des acides nucléiques) |
Tests diagnostiques pour certains pathogènes fongiques
Microorganisme | Microscopie | Culture | test d'amplification des acides nucléiques | Détection de l'antigène | Détection d'anticorps |
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Adapted from Bennett JE, Dolin R, Blaser MJ: Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases, 9th Edition. Elsevier, 2020. | |||||
NAAT = Nucleic Acid Amplification Test (Test d'amplification des acides nucléiques) |
Tests diagnostiques pour certains pathogènes viraux
Tests diagnostiques pour certains agents pathogènes protozoaires et parasitaires
Microorganisme | Microscopie | Culture | test d'amplification des acides nucléiques | Détection de l'antigène | Détection d'anticorps |
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Nématodes intestinaux | ✓ | ✓ | ✓ | ||
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Adapted from Bennett JE, Dolin R, Blaser MJ: Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases, 9th Edition. Elsevier, 2020. | |||||
NAAT = Nucleic Acid Amplification Test (Test d'amplification des acides nucléiques) |